從「無藥可用」到「無疾病證據」:GitLab聯創AI輔助抗癌路徑覆盤
律律动
GitLab 聯合創始人兼執行主席 Sid Sijbrandij 近日在 OpenAI Forum 活動中,與遺傳學家 Jacob Stern 共同分享了用 AI 輔助對抗骨肉瘤的完整經歷。Sid 於 2022 年底確診脊椎骨肉瘤,腫瘤直徑 6 釐米。2023 年經歷手術切除、脊柱融合、放療和高強度化療後,癌症仍在 2024 年復發,標準治療方案已基本耗盡,主治醫生無法推薦有效的下一步治療。
Sid 隨後辭去日常職務,組建個人醫療團隊,由前 10x Genomics 高管 Jacob Stern 主導運營,以「創始人模式」全面接管自己的治療決策。團隊採取「極限診斷」策略,對腫瘤進行單細胞測序、DNA/RNA 測序、靶向影像和類器官測試等全方位分析,累計產生 25TB 資料。單細胞測序發現腫瘤高度表達 FAP 蛋白,團隊據此在德國找到一種針對 FAP 的實驗性放射性配體療法。兩次治療後腫瘤壞死 60%、縮小 20%,並從脊髓硬膜脫離,外科醫生得以再次手術將其切除。
AI 在整個過程中充當加速器。Jacob 將腫瘤 RNA 測序資料直接輸入 GPT-4 分析,AI 標記出後來被證明關鍵的 B7H3 靶點,並識別出腫瘤免疫微環境的動態特徵。團隊還搭建了一套 Agent 系統,輸入自然語言問題後可自動完成文獻檢索、假設生成和生物資訊分析,單次執行約 20 美元、耗時 30 分鐘,可直接對 60 萬個單細胞資料執行分析並生成報告。在設計個性化 mRNA 腫瘤疫苗時,AI 也被用於輔助篩選候選新抗原。Jacob 表示,AI 不能替代專科醫生,但讓他「有能力成為專科醫生的合格對話者」,在自己並非專家的領域快速上手並推進合作。
Sid 表示經過靶向放射性治療和手術後,目前處於「無疾病證據」狀態,可用治療選項已從零擴充套件到 30 種。團隊正將這套方法產品化,已孵化 Thalus(基因表達分析與靶點發現)、Arden(複雜免疫疾病個性化治療)等公司,目標是降低個體化治療的門檻。
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